El MULI surge en el 2012 con la Bienal de Muralismo y su sede principal está ubicada en el Edificio de la Antigua Estación del Tren, que conserva su lobby, las vías y un vagón de tren abandonado en la parte trasera.
Esta sede cuenta con espacios diversos y lúgubres, túneles y pasadizos, conservando la arquitectura de la Antigua Estación, además de sus salas de exhibición de arte.